舞台は20××年。世界から数々の自然が姿を消し、機会が人を動かす時代に世界で唯一の自然が残る隠れた都市「鏡音町」が存在していた。
鏡音町に住む元気な高校生、空のクラスに謎の少女、亜衣が転校してきた頃から鏡音町に異変が起き始める。